אפיקי מים הינו תאגיד המים של עמק המעינות. יעוד התאגיד ומטרותיו הינו אספקת מים למרבית ישובי המועצה, אחזקה ושמירת איכות המים וניהול מפעל המים.

תפקיד המנכ"ל הינו ניהול ואחריות כוללת להפעלת האגודה. 

תחומי הניהול והאחריות המרכזיים:

• מערך הספקת המים לצרכנים - הקצאות המים, ניהול כמויות ואיכויות המים, קשר שוטף עם צרכני המים (קיבוצים, מושבים, אחרים, חקלאים וצרכנים פרטיים), מערך חיוב וגבייה, אחריות-על למערך התפעול.
• קשר עם גורמי שותפים מרכזיים וגורמי חוץ: מקורות, רשות המים, מועצה אזורית, מפעלים אזוריים ומשקי ב"ש, אחרים.
• עבודה מול רשות רגולטורית לרבות עבודה משפטית מול עו"ד לגבי תקנות וחוקי המים ואחריות על עלויות וממשק מול רשות המים.
• ניהול כלכלי של האגודה.
• ניהול מערך עובדי האגודה.
• ניהול והפעלת מוסדות האגודה: כינוס וריכוז מוסדות אפיקי מים, אפיקי מעיינות, אפיקי מים אנרגיה
• ניהול וכתיבת תכניות עבודה רב שנתיות בהתאם לאסטרטגיה החקלאית של האזור ולצריכת המים הנדרשת עקב כך.